"基因组科学"(4期/总23期)培训班通知

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开 班 时 间：    08年8月22-27日
上 课 内 容：    基因组学、蛋白质组学、系统生物学
上机实习内容： 1.基因组数据注释和分析；
2.核苷酸序列分析；
3.蛋白质结构与功能分析；
4.芯片数据的基本处理和分析；
5.蛋白质组学数据分析；
6.系统生物学软件实习-网络结构显示与分析。

       随着众多模式生物基因组测序项目的完成，生物学数据总量正在以每14个月翻一番的速度增长。面对海量数据，如何对它们进行科学地搜集、管理、处理、分析、注释，将是当今生物学家们急需学习和解决的问题。
       如果您想与时俱进，了解基因组科学、蛋白质组学、系统生物学前沿领域的内容和进展，快来参加我们举办的“基因组科学”研习班。在这里您可以听到由于军教授（注：于军被《科学美国人》评为2002年度世界科学领袖）亲自主讲的基因组学课程。林标扬教授（注：美国系统生物学研究所, 浙江大学纳米技术研究院兼职教授）主讲蛋白质组学和系统生物学内容。
       如果您想学习基因组、蛋白质数据分析、SNP、基因芯片等先进的技术手段，胡松年等教授将给您详细介绍。
       如果您想将基因组研究技术融合到自身正在从事的研究工作中，以提升研究水平，不妨来参加我们举办的“基因组科学”研习班。浙江大学郑树教授、薛庆中教授将分别述说基因组科学研究在医学和农学应用中的经验和体会。
       如果您想学习并掌握从互联网公共数据库获得数据的方法，学会处理数据、并提炼和挖掘有价值的信息的本领，您更应该来参加我们举办的“基因组科学”研习班。我们将给您提供优质服务，每人一台PC机，采用 “跟我学”方式，跟着实习指导老师大屏幕的演示进行操作。6次上机实习课。内容丰富多彩。您肯定会学有所获。
       虽然，“基因组科学”研习班的时间很短暂，凡来参加过的学员都认为是一次极好的“充电”机会。我们研习班已举办22期，学员来自全国20余个省市，每次研习班都有10余名教授、研究员参加，更多的是硕士生、博士生等年轻学者。也有一些单位带着课题或问题前来交流和联系，他们通过研习班建立了协作关系，共同申请课题，发表论文，其中不少优秀的研究成果，已在SCI期刊上发表。
       不学不会，早学早会。有志或有兴趣学习基因组、蛋白质组、系统生物学科研工作者、高校教师及研究生，热烈欢迎您前来杭州参加“基因组科学”研习班。

一、培训班上课内容
       上课内容围绕“基因组学－>蛋白质组学－>系统生物学”这条主线来讲述基因组学的研究技术方法、基本研究思路、前沿研究进展以及基因组学在各生物学科中的应用。主要内容如下：
  1. 基因组学基础及概论（讲课人：于 军教授）
2. 基因组学与比较基因组学的研究思路及进展（讲课人：于 军 教授）
3. EST、SNP、基因芯片、分子影像等技术专题讲座（讲课人：胡松年等教授）
4. 蛋白质组学和系统生物学导论及数据分析（讲课人：林标扬教授等）
5. 基因组学在医学、农学中应用（讲课人：郑 树、薛庆中教授）

二、培训班上机内容
       上机实习课采用 “跟我学”方式，学习生物信息学软件使用，每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。主要内容如下：
实习一： 基因组数据注释和功能分析
       通过序列比对工具BLAST的学习，了解基因功能注释的原理；介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA3，掌握系统发生树绘制的基本方法；认识基因重复(Gene Duplication)在进化上的功能。
实习二： 核苷酸序列分析
       利用生物信息学工具进行核苷酸序列分析，包括：基因预测，编码区结构分析，选择性剪切分析，基因启动子预测，基因调控元件预测，密码子偏好性分析等内容，学习基因序列分析常用的数据库和软件。
实习三： 芯片的基本数据处理和分析
       学习使用TM4软件来实现芯片的数据采集，低质量过滤，标准化处理及聚类等可视化分析。学习使用GenMAPP软件来挖掘芯片数据在代谢途径中的生物学意义。介绍NCBI GEO数据库，学习检索和提交芯片数据。
实习四：蛋白质结构与功能分析
       从搜索数据库中感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始，进一步利用网络软件和数据库工具，对蛋白质基本理化性质、二级结构、结构域和三维空间结构进行分析，预测目标蛋白的生物功能。
实习五： 蛋白质组学数据分析
       介绍蛋白质组学分析软件。利用X！Tandem软件鉴定蛋白质的串联质谱数据，将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白；使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
实习六：系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析
       介绍系统生物学软件，展示分子相互作用网络系统，并与基因表达等数据整合，利用Cytoscape系统生物学分析软件，了解和分析蛋白－蛋白相互作用，学习动态表达研究的方法。

       欲知详细课表和培训效果请见纳米技术研究院网页：http://www.zcni.zju.edu.cn/px_xinsheng.php

三、培训对象
       从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生。

四、报名方法
       若对本期研习内容有兴趣，请将以下报名表回执发送E-mail到genetrain@zju.edu.cn
或传真至（0571-86971760）。我们会立即回信，并登记在册，待五月底排定课表后发给您详细教学日程表（每节课时间、讲课主题、讲课人等）。待您确认后，发给您报到通知并排定上机号。

五、其他事项
培训地点：杭州 浙江大学华家池校区
收费标准：注册费为￥1800/人（含上机费）, 资料费200元 安排食宿、费用自理。
联 系 人：陈爱华 联系电话：13336100452
传 真：0571-86971760
电子邮件地址：genetrain@zju.edu.cn  
  
  浙 江 大 学
浙江加州国际纳米技术研究院
沃森基因组科学研究院
2008年5月8日